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・新マップが追加されている。
・Aランク以下のモンスターは全て進化配合できる。(スライム×スライムの配合など)
・新特技、特性が追加。
・新モンスターが100体以上追加
・DQMJ2から引き継ぎ可能。Aランク以下のモンスター、引き継いだらレベル1、スキルポイント・系統・配合回数がリセット、一部のスキルはそのまま引き継げないなどの制限はある。
・すれちがいバトルで一度に3人まですれちがい可能。すれちがいでスカウトできるモンスターはAランクまでになっている。
・すれちがい通信で過去作のテリー、イルルカが乱入する場合がある。わたぼう、ワルぼうを仲間にできるかもしれない。
・作戦の「いろいろやろうぜ」がなくなり「サポートたのむぞ」と「せんりょくうばえ」が追加された。